A、氢气的密度比空气小，不能使用向上排空气法收集，故A实验操作错误；
B、二氧化碳的密度比空气大，不能使用向下排空气法收集，故B实验操作错误；
C、排水法收集氧气结束时，先把导管移出水面，再熄灭酒精灯，以防止水槽中的水倒吸入试管，使试管因骤然冷却而炸裂，故C实验操作错误；
D、如图，因为压强的原因，氢气从A端进入，水会从B导管的下端进入导管，并从B端排出．所以，用排水法收集氢气时，导管不能伸到集气瓶底部，故D实验操作正确；
故选：D．