A、神经系统调节机体活动的基本方式是反射，其结构基础是反射弧，A正确；
B、反射弧一般由三个神经元细胞组成，但对于一些特殊的反射弧（膝跳反射）却是由两个神经元细胞组成的，B正确；
C、神经递质经胞吐方式通过突触前膜，作用于突触后膜而传递兴奋，C错误；
D、兴奋时神经纤维膜内局部电流方向与兴奋传导是一致的，即从兴奋部位流向未兴奋部位，D正确．
故选：C．