（1）由题意知，某DNA分子中含有400个碱基对，800个碱基，胸腺嘧啶T是120个，那么腺嘌呤A=120个，该DNA分子中G=C=（800-120×2）÷2=280个，又因为A=T对含有2个氢键，G=C对3个氢键，所以氢键数=120×2+280×3=1080个．
（2）根据DNA分子的结构特点可知一个DNA分子只有2个游离的脱氧核糖和2个游离的磷酸基团．
故选：D．