蓝藻是原核生物,又叫蓝绿藻 蓝细菌；大多数蓝藻的细胞壁外面有胶质衣,因此又叫粘藻.在所有藻类生物中,蓝藻是最简单、最原始的一种.蓝藻是单细胞生物,没有细胞核,但细胞中央含有核物质,通常呈颗粒状或网状,染色质和色素均匀的分布在细胞质中.该核物质没有核膜和核仁,但具有核的功能,故称其为原核（或拟核）.
蓝藻细胞模式图蓝藻不具叶绿体、线粒体、高尔基体、中心体、内质网和液泡等细胞器,含叶绿素a,无叶绿素b,含数种叶黄素和胡萝卜素,还含有藻胆素（是藻红素、藻蓝素和别藻蓝素的总称）.
其结构如图：