①生物膜组成成分是脂质和蛋白质，磷脂双分子层构成基本骨架，细胞都具有细胞膜，均具有磷脂双分子层与蛋白质构成的膜结构，是细胞基本共性，①正确；
②ATP是直接的主要能源物质，ATP是所有细胞可直接利用的能源物质，是细胞基本共性，②正确；
③不论是真核细胞还是原核细胞，都具有核糖体，都具有核糖体作为蛋白质合成的“机器，是细胞基本共性，③正确；
④遗传信息均储存在脱氧核糖核酸分子中，是细胞基本共性，④正确；
⑤所以生物公共用一套遗传密码，所以编码氨基酸的密码子基本相同，是细胞基本共性，⑤正确；
⑥细胞是最基本的生命系统，是生物体结构和功能的基本单位，因此所有生物的新陈代谢都是以细胞为单位进行的，是细胞基本共性，⑥正确．
综上所述①②③④⑤⑥都是细胞基本共性．
故选：D．