A、当气孔关闭时，植物体内部的水分无法散发到体外，从而影响植物体的蒸腾作用；A错误；
B、又由于呼吸作用的原料之一是氧气，从而也影响了植物体的呼吸作用．B错误；
C、蒸腾作用是水分、无机盐的运输动力，因此气孔关闭时也会影响水分、无机盐的运输．但不直接影响无机盐的吸收；
D、当气孔关闭时，外界的气体如二氧化碳、水、氧气等气体无法进入植物体，由于二氧化碳和水是植物进行光合作用的原料，从而影响植物体进行光合作用，D错误．
故选：C．