设水流的速度是x千米/小时,则船在顺水中的速度是(x+16)千米/小时,在逆水中的速度是(16-x)千米/小时,40分钟=2/3小时；甲乙码头的距离是4(x+16)千米,或者表示为(4+2/3)(16-x)千米,有方程：
4(x+16)=(4+2/3)(16-x)
4(x+16)=(14/3)(16-x)去分母,方程两边同时乘3
12(x+16)=14(16-x)去括号
12x+192=224-14x移项
12x+14x=224-192 合并
26x=32 系数化1
x=16/13
答：水流的速度是16/13千米/小时.