A、核糖体有核糖体RNA和蛋白质组成，不含色素，A错误；
B、液泡贮藏多种营养物质和色素，则花瓣细胞中红色色素存储在液泡中，B正确；
C、线粒体是有氧呼吸的主要场所，不含色素，C错误；
D、内质网是单层膜折叠体，不含色素，D错误．
故选：B．