A、色素提取液中的不同色素并没有分层，A错误；
B、阳光的照射不能使各种色素彼此分开，B错误；
C、色素在层析液中的溶解度不同，随着层析液扩散的速度不同，C正确；
D、丙酮使色素溶解，但不能将色素彼此分离，D错误．
故选：C．