生物呼吸作用的表达式为：有机物+氧→二氧化碳+水+能量，呼吸作用是生物的基本特征，所以黄豆在萌发的过程中，要进行呼吸作用，消耗黄豆体内的有机物，由黄豆到豆芽的过程中吸收大量的水，所以会有500克黄豆制成2500克黄豆芽，而在此过程中由于不含叶绿素无法进行光合作用，所以黄豆体内的有机物会逐渐减少．
故选：B．