A、某地区灰仓鼠每年新增的个体数为出生率的范畴，不属于种群密度，A错误；
B、一亩水稻的年产量不是种群密度，B错误；
C、杂草不一定是同一个物种，不是一个种群，C错误；
D、根据分析，某湖泊每平方米水面鲫鱼的数量为种群密度，D正确．
故选：D．