A、B、糖水和食盐水（氯化钠溶液）是一种溶液肯定不是由一个分子构成的．故A、B不适合；
C、海水不是纯净物，更不可能是由一个分子构成的．故C不适合；
D、蒸馏水的成分是水，它是由水分子构成的．
故选：D．