在等电点时,各种蛋白质仍有一定的溶解度而使沉淀不完全.
所有的蛋白质都具有等电点,在等电点时它们的电荷为零,溶解度最小,但是不一定所有的蛋白质在等电点都会沉淀.等电点沉淀在应用于酸性或碱性目的蛋白时也许效果很好,但是对于具有中性等电点的蛋白,尽管pH在它的等电点处,但是它有可能含有净电荷很不相同的区域,这时很难或不可能用中性等电点来沉淀这些蛋白质.