A、原子核、电子等都是带电的微粒，故带电的微粒不一定是离子，故A错误；
B、单质是指由一种元素组成的纯净物，故单质一定是由同种元素组成的，故B正确；
C、纯净物是由一种物质组成的，但是构成物质的微粒不只是分子，还有原子等，如铁是由铁原子构成的，故C错误；
D、氧化物指含有两种元素且其中一种是氧元素的化合物，但是含氧化合物不一定是由两种元素组成，如H₂SO₄，是由三种元素组成，不是氧化物，故D错误；
故选B．