A、多对黄鼠交配，后代总出现1/3的黑鼠，说明黄色相对于黑色是显性性状，A错误；
B、子代分离比为黄色：黑色=3：1，其中黑鼠占1/4，而实际杂交后代中黑鼠约占1/3，说明显性纯合子致死，即后代黄鼠均为杂合子，B错误；
C、黄鼠后代出现黑鼠是由等位基因分离导致的，C错误；
D、黄鼠（Aa）与黑鼠（aa）交配，后代中黄鼠约占1/2，D正确．
故选D．