A、真核生物与原核生物最主要的区别是真核生物（酵母菌）有核膜包被的细胞核，而原核细胞（固氮菌）没有，故A正确，
B、原核生物和真核生物都有细胞膜，故B错误，
CD、原核生物只有核糖体一种细胞器，线粒体、内质网等都是真核生物特有的，故CD正确．
故选B．