（1）由表1看出A组与B组实验上存在两点不同①水温②水源，结果B组孵化率较低，原因可能出在水温，也可能出在水源，还可能与水温和水源都有关．
（2）①A组与B组的变量是水温，C组与D组的变量也是水温，如果A、C组的孵化率高，说明水温对蛙卵的孵化具有重要影响，温度较高（22-25℃），孵化率高．
②A组与C组的变量是水源，B组与D组的变量也是水源，如果A、B组的孵化率高，说明水质对蛙卵的孵化也具有重要影响，池塘水有利于孵化．
③对比表1和表2的实验方案，表2的实验方案更好些．因为表2形成对比时可以有单一变量．
故答案为：（1）水温和水源的问题．
（2）①水温对蛙卵的孵化具有重要影响，温度较高，孵化率高．
②水质对蛙卵的孵化也具有重要影响，池塘水有利于孵化．
③表2；符合单一变量原则．