A、真核细胞内基因的存在部位是细胞核、线粒体和叶绿体中，不一定存在于细胞核中的染色体上，A错误；
B、由碱基互补配对原则可知，该基因中A=T=20%，G=C=30%，双链DNA分子中

G+C

A+T

的比值与每一天单链都相同，是

30%+30%

20%+20%

=

3

2

，B正确；
C、解旋酶的作用是作用于碱基对之间的氢键，是DNA双链结构打开，形成单链，不是催化该基因水解为多个脱氧核苷酸，C错误；
D、由题意可知，该基因中G=30%×2000=600，复制三次需要的游离的鸟嘌呤脱氧核苷酸的数目是（2³-1）×600=4200个，D错误．
故选：B．