ATP既可以作为反应底物又可以作为变构抑制剂,其原因在于：此酶有二个ATP结合位点,一个是与作为底物的ATP结合位点,另一个是与作为变构抑制剂的ATP结合位点,两个位点对ATP的亲和力不同,ATP与底物的ATP结合位点亲和力高,与变构抑制剂的ATP结合位点亲和力低.这样,当细胞内ATP不足时,ATP主要作为反应底物,保证酶促反应进行；当细胞内ATP较多时,ATP作为变构抑制剂,可降低6-磷酸果糖激酶1的催化活力.