属于原生生物界中的单细胞藻类有裸藻门、甲藻门（或称涡鞭毛藻）、隐藻门、金黄藻门（包括硅藻等浮游藻）、红藻门、绿藻门和褐藻门.而生殖构造复杂的轮藻门则属于植物界,并且是多细胞.属于大型藻者一般仅有红藻门、绿藻门（除小球藻）和褐藻门等为大型肉眼可显而易见之固著性多细胞藻类.此类大型藻几乎99%以上之种类栖息于海水环境中,故大型藻多以海藻称之.