洋葱表皮细胞、番茄果肉细胞以及根尖的纵切片细胞的结构都有细胞壁、细胞膜、细胞核、细胞质和液泡，它们都不能进行光合作用，因为没有叶绿体；菠菜叶片细胞除了有细胞壁、细胞膜、细胞核、细胞质和液泡外，还有叶绿体，所以能够进行光合作用，所以在显微镜下能观察到叶绿体．
故选：C