模板链上是在3端没错,而转录的启动子在5端是针对编码链而言,编码链和mRNA对应的启动子在模版连得3端编码连的5端？？ 一个DNA双链有几个启动子更确切的说吧，启动子是一段位于结构基因5‘端上游区的DNA序列。在模板DNA上当然就对应着3'端喽。额 模板DNA不是结构基因？？DNA分子是由两条互相平行的脱氧核糖核苷酸链构成，这两条链通过碱基配对连接，比如A=T, G=C, 并且这两条链（设为a链和b链）5’3‘的方向相反，即一条链的5’端对应另一条链的3‘端。当转录的时候，比如要转录翻译蛋白P的编码链是a（也叫正义链），那么b就是它的模板链（也叫反义链），以b为模板转录出来的mRNA的核苷酸是与a链对应的。
我说的结构基因是指整个涉及蛋白信息的双链而言，不管编码链还是模板链。你要明白，模板仅仅指在双链分开进行复制或者转录而言，而且仅仅针对某个具体蛋白，蛋白P的模板链可以是另一个蛋白K的编码链。