A、蛋白质的消化分解成氨基酸是在消化道内进行的，消化道与外界环境相通，其内的液体不是内环境，C错误；
B、神经递质与激素是在细胞内合成的，不发生在细胞外，即不发生在内环境中，B错误；
C、丙酮酸氧化分解成二氧化碳和水在细胞的线粒体中进行，不发生在细胞外，即不发生在内环境中，C错误；
D、乳酸与碳酸氢钠作用生成乳酸钠和碳酸发生在血浆中，是发生在内环境中的化学反应，D正确．
故选：D．