原核：细菌、放线菌、螺旋体、支原体、立克次氏体、衣原体.真核：真菌、藻类(部分)、原生动物（部分）.非细胞类：病毒和亚病毒.一般地,在中国大陆地区的教科书中,均将微生物划分为以下8大类细菌、病毒、真菌、放线菌（广义上属于细菌的一种）、立克次体、支原体、衣原体、螺旋体.