A、大多数基因位于细胞核的染色体上，少数位于细胞质中，故染色体是基因的主要载体，A正确；
B、基因在染色体上呈线性排列，B正确；
C、一条染色体含有1个或2个DNA分子，其上有多个基因，C正确；
D、染色体是由DNA和蛋白质组成的，D错误．
故选：D．