狗的下丘脑神经细胞与其肌细胞都是由同一个受精卵有丝分裂而来的，因此两者含有相同的遗传物质，但由于基因的选择性表达，使这两种细胞的形态、结构和功能发生了稳定性差异．所以狗的下丘脑神经细胞与其肌细胞的结构和功能不同的根本原因是基因表达产生的mRNA不同（mRNA产生后由核孔进入细胞质）．
故选：D．