A、猫叫综合症是人的第5号染色体部分缺失引起的遗传病，属于染色体变异，A错误；
B、豌豆是2倍体，培养成4倍体的原理是染色体变异，B错误；
C、人的色盲是基因突变引起的，C错误；
D、高茎豌豆的自交出现矮茎是杂合高茎豌豆形成配子时等位基因分离的结果，不属于突变和基因重组的范畴，D正确．
故选：D．