一个脱氧核苷酸分子由三个分子组成：一分子含氮碱基、一分子脱氧核糖、一分子磷酸.而氢键是连接两个含氮碱基的键,而不是连接脱氧核糖核苷酸之间的化学键.其分子链是由互补的核苷酸配对组成,而两条链依靠氢链结合在一起.
连接核糖核苷酸之问的化学键也是由互补的核苷酸配对组成.