A、设溶液的体积都为1L，CH₃COOH为弱酸，在25℃时将pH=11的NaOH溶液与pH=3的CH₃COOH溶掖等体积混合时，醋酸过量，反应后的溶液中有n（Na⁺）=0.001mol，n（CH₃COO^-）+
n（CH₃COOH）＞0.001mol，则c（Na⁺）＜c（CH₃COO^-）+c（CH₃COOH），故A错误；
B、根据溶液呈电中性，溶液中存在c（Na⁺）+c（H⁺）=c（OH^-）+c（CH₃COO^-），则c（H⁺）＜c（CH₃COO^-）+c（OH^-），故B错误；
C、在25℃时将pH=11的NaOH溶液与pH=3的CH₃COOH溶液等体积混合时，醋酸过量，则c（CH₃COO^-）＞c（Na⁺），故C错误；
D、在25℃时将pH=11的NaOH溶液与pH=3的CH₃COOH溶液等体积混合时，醋酸过量，溶液呈酸性，则有c（CH₃COO^-）＞c（Na⁺），c（H⁺）＞c（OH^-），由于H⁺离子与OH^-离子反应，则溶液中c（Na⁺）＞c（H⁺），所以有c（CH₃COO^-）＞c（Na⁺）＞c（H⁺）＞c（OH^-），故D正确．
故选D．