A、利用B超检查身体，就是利用了超声波传递信息，不符合题意；
B、利用声呐探测海洋深度，是利用了声波传递信息，不符合题意；
C、利用超声波除去人体内的结石，是利用了声波传递能量，符合题意；
D、医生用听诊器诊断疾病，是利用了声波传递信息，不符合题意．
故选C．