前面的步骤没有操作好,要么是你的样品比较特殊,含有较多的色素或脂肪,先用电泳检测一下,如果条带清楚就可以用,如果混乱要修改实验设计.
不知道你提的是动物还是植物的DNA,估计可能是植物色素或者是叶片的蜡质层,甚至可能是药品本身变质发生反应造成的.
提DNA要多做几个重复,逐个排查问题,当然最终的结果是电泳检测结果说了算的.如果检测条带不清楚一般重提一次,如果仍然不清楚那么就要修改方法了.条带清楚到什么程度就可以用是根据你实验的要求定的,比如做ISSR或者RAPD对条带要求就低一点,做SSR要求就要高些.