废丞相,先由六部分理朝政,后由与洪武十三年（朱元璋的年号）设内阁,由内阁接替丞相的职务（称为首辅）,但没有丞相的权利,内阁的官员都是临时的,皇帝先贬官就贬官,且没有品级.明成祖时期,内阁可上朝参政,设正五品.
创锦衣卫（洪武十五年）,锦衣卫的职务是调查官员百姓的情况,可直接上报皇帝,有抓人的权利,并且设有独立的衙门,遇有重大的政治案件,无需经过刑部吏部大理寺等机构,完全由锦衣卫查办.永乐十八年设立东厂,成化十三年设立西厂.
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