12=2×2×3，
所以12可以写成：2×6，4×3，12×1，2×2×3；
即用12个小正方体可以组成棱长分别为1厘米、2厘米、6厘米；2厘米、2厘米、3厘米；4厘米，3厘米，1厘米；1厘米、1厘米、12厘米的四种长方体．
答：可以拼成4种不同的长方体；
故选：C．