A、石灰水中含有水和氢氧化钙，属于混合物；
B、空气中含有氮气、氧气、二氧化碳等物质，属于混合物；
C、生铁中含有铁、碳等物质，属于混合物；
D、水是由一种物质组成的，属于纯净物．
故选：D．