物理化学性质且空间结构相近的氨基酸取代不一定引起蛋白质活性降低.一般来说,所带电荷、侧链长短及分枝情况相差较大的氨基酸取代容易产生蛋白突变.比如脯氨酸取代可使a-螺旋中断,破坏蛋白质高级结构,或是带正电的氨基酸取代带负电的氨基酸,改变蛋白质活性部位净电荷数,容易活性降低等等.