我又另外一个例句,应该比较容易懂……
Beware of any occupation that requires a new set of clothes.
意思：请注意,不同的职业要求不同的着装.
a new set of clothes应该是另一种类型,适合这种职业的着装
所以你给出的例句：
I lost my lecture notes and had to make out a new set.
我的演讲稿丢了,我只能重起炉灶,另写新的一份.
这里的SET只是一种口语化的指代,也就是一份（名词）
就像在口语里喜欢用CASE,GUY来指代人或物
所以a new set ：新的一份（稿件）