A、种群指生活在同一地点同种生物的一群个体，A错误；
B、群落同一时间内聚集在一定区域中各种生物种群的集合，B错误；
C、生态系统包括生物群落和无机环境，C错误；
D、农贸市场上鸡、鸭、鱼、青菜、蘑菇等这些生物既不是种群，也不是群落，也不是生态系统，D正确．
故选：D．