A、观察桃花的结构用放大镜就可以，故不符合题意；
B、观测太阳黑子的多少和大小用望远镜，故不符合题意；
C、观察洋葱表皮细胞的结构，需要用显微镜，故符合题意；
D、土壤中是否含有有机物需要用化学的方法研究，不能通过观察知道，故错误．
故选：C．