A、硫酸铜、食盐、纯碱等物质都是由金属离子和酸根离子组成的化合物，属于盐，分类正确；
B、磷酸铵中含有氮元素和磷元素，属于复合肥；硝酸钾中含有氮元素和钾元素，属于复合肥；硫酸铵是含有氮元素的化肥，属于氮肥；分类错误；
C、空气、煤气、碘酒等物质都是由多种物质组成的，属于混合物，分类正确；
D、硫元素、氧元素、氦元素都属于非金属元素，分类正确．
故选：B．