从54个学生中用系统抽样抽取4个人的一个样本，
分组时要先剔除两人后分成4个小组，
每一个小组有13人，
∵学号为3号，29号，42号的同学在样本中，即第一个学号是3，
∴第二个抽取的学号是3+13=16，
故答案为：16