丙酮酸进入线粒体是一种主动运输方式,由专门的丙酮酸载体运输（这种载体也可以运送乳酸盐）.运输方式是协同运输中的反向运输（antiport),与线粒体中的氢氧根离子交换.运输的动力是线粒体内膜两侧的pH差（ΔpH）.