We are friends这个已经说"我们是朋友"
后面的如果跟着"are we?"就是说"我们是吗?"
有点否认的意思.
根据你的问题应该是用"aren't we","不是吗?"的意思
反义疑问句,其实你把两句话放在一起其实就能看出不同了:
我们是朋友,我们是吗?
我们是朋友,不是吗?