A、观察植物细胞的质壁分离与复原、叶绿体中色素的提取和分离在实验设计中不需要设置对照，只有探究温度对淀粉酶活性的影响在实验设计中需要有对照，A错误；
B、观察植物细胞的质壁分离与复原、叶绿体中色素的提取和分离在实验过程中都不需要进行加热，B错误；
C、观察植物细胞的质壁分离与复原实验中，液泡颜色先由浅变深后由深变浅；叶绿体中色素的提取和分离实验中滤纸条上出现不同的色素带；探究温度对淀粉酶活性的影响实验中碘液使淀粉溶液变蓝，C正确；
D、只有观察植物细胞的质壁分离与复原实验中的实验材料都始终保持生物活性，叶绿体中色素的提取和分离实验中由于研磨使细胞破裂，探究温度对淀粉酶活性的影响实验中由于高温使酶活性失去，D错误．
故选：C．