1.这里什么从句都不是,而是强调句型.
2.强调句型结构如下：It is/was + 被强调部分 + that + 句子的未被强调部分.
该句型的最大特点是：去掉it is/was和引导词that之后,剩下的部分可以组成一个完整的句子（不强调主语时,则需要调整句序）.
3.该题去掉it's和that之后为：The thoughts count.或 The thought counts.（楼主打字有误,thoughts做主语时,单词不会用三单形式）.
这就是一个完整的句子,意思是“思想/想法（才）重要/要紧/有价值/有意义”.
所以该句是一个强调了主语的强调句型结构,而不存在所谓的从句.