A、蛋白质中的N元素是矿质元素，A错误；
B、由A分析知，B错误；
C、核酸中的N、P属于矿质元素，C错误；
D、糖类的组成元素是C、H、O，水中的组成元素是H、O，C、H、O不属于矿质元素，D正确．
故选：D．