卵裂球时期使用胰酶消化,是因为消化得到的卵裂球具有在体外再独自发育成胚胎的能力.而到了囊胚期后,就算用胰酶消化,消化得到的单细胞也是无法再体外在发育成胚胎的（况且囊胚期的内细胞团细胞之间的连接非常紧密,胰酶很难将它们分离开）,因此采用分割针机械分离,一般是将胚胎各部分都平分,包括外层滋养细胞以及内细胞团都需要平分,只有这样分离得到的部分才可能在体外再形成一个完整的胚胎进而发育成个体.
这样是为什么在卵裂球期用胰酶分割是不需要到具有内胚层的原因.