氧化磷酸化是指放能的氧化作用而进行的磷酸化作用,包括底物水平磷酸化和电子传递体系磷酸化,但是通常所说的氧化磷酸化是指电子传递体系的磷酸化.
底物水平磷酸化是在被氧化物的底物上发生磷酸化作用即底物被氧化过程中,形成某些高能磷酸化合物的中间产物,通过酶作用可使ADP生成ATP.直接生成ATP.糖酵解第一次底物水平磷酸化：甘油酸-1,3-二磷酸和ADP 在甘油酸磷酸激酶和镁离子的作用下ATP和甘油酸-3-磷酸和ATP
电子传递体系磷酸化：当电子从NADH或FADH2经过呼吸链传递给氧形成水时,同时伴有ADP磷酸化成ATP.基本上看到有NADH,NADPH或FADH2,FMNH2,就是电子传递体系的磷酸化.这个例子很多：三羧酸循环中异柠檬酸氧化脱羧形成阿发酮戊二酸