A、诱变育种可以通过基因突变使水稻产生抗病基因，A正确；
B、单倍体育种过程：先花药离体培养得到单倍体植株，再用秋水仙素加倍，而其本身缺少抗病基因，因此不适宜改良缺乏某种抗病性的水稻品种，B错误；
C、基因工程育种可以将其它生物的抗病基因转移到水稻细胞内，C正确；
D、杂交育种能将不同植株的优良性状集中在一个个体上，因此该方法也能用来改良缺乏某种抗病性的水稻品种，D正确．
故选：B．