选 it
因为先行词是 the effect,如果填 that,那么从句就是：the effect will have on you.这个是不对的,因为,后果不会主动地作用到你.
填 it,实际是省略了联系词 that.从句就是：it will have effect on you.
这里的 effect 在从句里做宾语.it 是指“离开”那个动作.