湄公河的上游流经地区地形起伏较大,沿途受山脉阻挡,河道几经弯曲,河谷宽窄反复交替,河床坡降较陡,多急流和浅滩.中游流经呵叻高原和富良山脉的山脚丘陵,大部分地区地形起伏不大.但是沙湾拿吉至巴色河段,河床坡降较陡,多岩礁、浅滩和急流.下游流经地区为平坦而略为起伏的准平原,海拔不到100米,河床宽阔,多汊流,但部分河段有小丘紧束或横亘河中,构成险滩、急流.修筑水利设施的难度较大.